1789年、アダム・ラクスマンはシベリアのイルクーツクに滞在中、大黒屋光太夫ら日本人漂流民6名と出会った。後に、光太夫を連れて ペテルブルグの女帝エカテリーナ2世と謁見し、光太夫の送還につき許しをえる。女帝の命により、大黒屋光太夫、磯吉、小市の3名 を送還する名目で、イルクーツク総督の通商要望信書を手渡すために、ロシア帝国最初の遣日使節となる。

1790年（寛政2年）、嘉兵衛、兵庫に出て、樽廻船の水主として働く。
1792年（寛政4年）、嘉兵衛、24歳 (数え年) の時、水主から表仕（おもてし）（船の進路を指揮する役）となる。
1792年（寛政4年）9月、ロシア遣日使節アダム・ラクスマンが、神昌丸の漂流民大黒屋光太夫、磯吉を連れて エカテリーナ号でオホーツクを出発、翌月根室に来航し通商を求める。幕府側は通商を欲するなら長崎に回航するよう指示する。

1793年（寛政5年）6月、エカテリーナ号函館に入港する。ラクスマン一行は函館から陸路で松前に到着する。幕府側は長崎以外では 国書を受理できないと受け取りを拒否し、この通商問題は長崎でのみ交渉しうるとして、ラクスマンに対し信牌 (しんぱい)(長崎入港許可証) を与えた後、長崎に回航するよう指示した。他方、大黒屋光太夫と磯吉2名を引き取った。
1793年7月、ラクスマンらは函館を出港したが、長崎には向かわず、オホーツクに帰還した。

1793年（寛政5年）、嘉兵衛、沖船頭（雇われ船頭）となる。
1796年（寛政8年）、辰悦丸が建造される。
1798年（寛政10年）、嘉兵衛、辰悦丸を和泉屋伊兵衛から譲り受け、船持ち船頭として独立か。函館に出店する。
1799年（寛政11年）7月、嘉兵衛、幕命により、クナシリ－エトロフ島間の航路を拓く。

1800年（寛政12年）、嘉兵衛、エトロフ島西海岸にて17カ所の漁場を拓く。また、エトロフ航路開拓の功績を幕府から認められ、同年の1800年 に蝦夷地開拓用の官船5艘の建造を命じられる。嘉兵衛はそれを皮切りに1809年（文化6年）までに45艘の官船建造を請け負った。
1800年5月、伊能忠敬、蝦夷地を測量する。
1802年（享和2年）、幕府、蝦夷奉行　（5月、函館奉行と改称）を置く。
1804年（文化元年）9月、ロシア遣日使節（第二次）のレザノフが通商を求めて、ロシア皇帝アレクサンドル一世から 日本国皇帝 (将軍) に宛てた親書を携え、長崎に来航する。
1806年、アダム・ラクスマン、「ラクスマン日本渡航日記」を完成。

1806年（文化3年）9月、ロシアのフヴォストフらがカラフトに来襲する。
1807年（文化4年）4月、ロシアのフヴォストフらがカラフト・エトロフ島に来襲する。
・　同年、幕府、奥羽諸藩に出兵を命じる。
・　同年10月、幕府、函館奉行所を松前に移し、松前奉行と改称する。
・　同年12月、幕府、ロシア船の打ち払いを命じる。
1808年（文化5年）、間宮林蔵らがカラフトに赴き、カラフトが島であることを発見する。
・　同年、イギリス軍艦フェートン号が長崎港に乱入する。
1809年（文化6年）、間宮林蔵、アムール川（黒竜江）地方を探検する。

1811年（文化8年）5月、ロシア軍艦ディアナ号が、千島列島を調査・測量、クナシリ島に来航する。
松前奉行所クナシリ詰役人が、ディアナ号艦長ゴロウニンら8名を捕らえ、函館に連行する。
ゴロウニンらは松前へ連行、拘留される。